Bnem

doi：10.18129/b9.bioc.bnem

从扰动实验的间接测量中训练逻辑模型

生物导体版本：版本（3.13）

BNEM结合了嵌套效应模型（软件包MNEM）间接测量的使用与Cellnoptr的布尔网络的使用。分析了细胞中信号传导淋巴结的扰动实验，以实现其对全局基因表达谱的影响。这些概况为网络中下游节点的布尔调节提供了证据，例如，两个父母是独立地（OR-GATE）还是联合（和栅极）激活孩子。

作者：Martin Pirkl [AUT，CRE]

维护者：Martin Pirkl

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ bnem”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Bnem”）

html	R脚本	bnem.html
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.0.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（<6个月）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.1）
进口	Cellnoptr，，，，矩阵，，，，降雪，，，，rgraphviz，，，，簇，，，，Flexclust，统计rcolorbrewer，，，，Epinem，，，，mnem，，，，生物酶，方法，utils，图形，图形，，，，副词，，，，Binom，，，，林玛，，，，SVA，，，，VSN，，，，rmarkDown
链接
建议	尼特，，，，生物基因
系统要求
增强
URL	https://github.com/martinfxp/bnem/
BugReports	https://github.com/martinfxp/bnem/issues
取决于我
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建议我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	bnem_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制	BNEM_1.0.0.ZIP
MacOS 10.13（高山脉）	BNEM_1.0.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bnem
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/bnem
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/bnem/
软件包下载报告	下载统计