Bioconductor版本:释放(3.13)
CBIOPortalData包从Cbioportal等存储库中取出压缩资源,并使用Biocometion类组装MultiAsaySayexPeriment对象。
作者:Levi Waldron [Aut],Marcel Ramos [Aut,CRE]
维护者:Marcel Ramos
引文(从R内,输入引文(“CBIOPORTALDATA”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!procenameSpace(“biocmanager”,静静= true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“cbioportaldata”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“CBIOPORTALDATA”)
HTML. | r script. | CBIOPORTAL快速启动指南 |
HTML. | r script. | CBIOPortal用户指南 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版本 | 2.4.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.11(R-4.0)(1年) |
执照 | AGPL-3 |
依靠 | r(> = 4.0.0),砧那MultiAsaySayexperiment. |
进口 | biocfilecache.(> = 1.5.3),消化那dplyr.那Genomeinfodb.那Genomicranges.那httr.那绞喉, 方法,读书那raggedexperiment.那rtcgatoolbox.(> = 2.19.7),S4Vectors.那概括分析,统计,娇媚那Tidyr.那tcgautils.(> = 1.9.4),UILS |
链接到 | |
建议 | 生物焦那kn那生存那SURVMINER.那RAMAMAMDOW.那testthat. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
Bugreports. | https://github.com/waldronlab/cbioportaldata/issues. |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
源包 | cbioportaldata_2.4.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | cbioportaldata_2.4.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | cbioportaldata_2.4.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/cbioportaldata. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包/ cbioportaldata |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/cbioportaldata/ |
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