categoryCompare

DOI:10.18129 / B9.bioc.categoryCompare

使用特性注释的高通量实验的元分析

生物导体版本:发布(3.12)

计算两个(或多个)特征(如基因)列表中的每个重要注释(类别)，确定注释之间的重叠，并返回关于重要注释的图形和表格数据，以及发现哪些特征列表组合的注释是重要的。交互式探索可以通过使用RCytoscape(强烈建议)来实现。

作者:Robert M. Flight

维护者:Robert M. Flight

安装

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如果(!安装BiocManager::install("categoryCompare")

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文档

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browseVignettes(“categoryCompare”)

超文本标记语言	R脚本	categories compare:使用基因注释的高通量数据元分析
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细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.34.0
Bioconductor自	BioC 2.10 (R-2.15)(9年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.10),Biobase,BiocGenerics(> = 0.13.8)
进口	AnnotationDbi,hwriter,GSEABase,类别(> = 2.33.1),GOstats,注释,色彩,图,RCy3(>= 1.99.29)，方法，grDevices, utils
链接
建议	knitr,GO.db,KEGG.db,雌激素,org.Hs.eg.db,hgu95av2.db,limma,affy,genefilter
SystemRequirements	Cytoscape(>= 3.6.1)(如果用于结果可视化，强烈建议)
增强了
URL	https://github.com/rmflight/categoryCompare
BugReports	https://github.com/rmflight/categoryCompare/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	categoryCompare_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	categoryCompare_1.34.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	categoryCompare_1.34.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/categoryCompare
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ categoryCompare
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/categoryCompare/
包下载报告	下载数据