细胞

DOI:10.18129 / b9.bioc.celltree.

单个小区RNA-SEQ数据的推理和可视化作为分层树结构

Bioconductor版本:释放(3.13)

此软件包计算单个单元RNA-SEQ数据的潜在Dirichlet分配(LDA)模型,并在时间或空间内构建一个模型关系之间的关系。

作者:David Duverle [Aut,Cre],Koji Tsuda [Aut]

维护者:David Duverle

引文(从R内,输入引文(“Celltree”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percenamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“celltree”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“CELLTREE”)

PDF. r script. 单小区RNA-SEQ数据数据的推理和可视化作为分层树结构
PDF. 参考手册

细节

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版本 1.22.0
在生物导体中以来 BIOC 3.3(R-3.3)(5年)
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 3.3),顶点
进口 主题修改slmaptpx.iGraph.xtable.贡献
链接到
建议 生物焦knhsmmsinglecell.生物雕org.hs.eg.db.BioBase., 工具
系统要求
加强
URL. http://tsudalab.org.
取决于我
进口我
建议我
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建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 celltree_1.22.0.tar.gz.
Windows二进制文件 celltree_1.22.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) celltree_1.22.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/celltree.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/蜂窝
包短网址 https://biocumon.org/packages/celltree/
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