Cellxgenedp

doi:10.18129/b9.bioc.cellxgenedp

在CellXgene数据门户中发现并访问单元数据集

生物导体版本:版本(3.15)

CellXgene数据门户(https://cellxgene.cziscience.com/)提供了一个图形用户界面,以通过标准方式处理的单细胞序列数据的集合来“计数矩阵”摘要。CellXgenedP软件包提供了一个基于R的替代性信息,允许数据发现,查看和下载。

作者:马丁·摩根[AUT,CRE],Kayla Interdonato [AUT],Daniel Parker [AUT,CPH](JSONCONS C ++图书馆创建者)

维护者:Martin Morgan

引用(从r内,输入引用(“ CellXgenedp”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ cellxgenedp”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ CellXgenedp”)

html R脚本 从CellXgene数据门户发现并下载数据集和文件
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.0.1
在生物导体中 Bioc 3.15(R-4.2)(<6个月)
执照 Artistic-2.0 |BSL-1.0 |文件执照
要看
进口 dplyr,,,,httr,,,,卷曲,,,,jsonlite,utils,工具,并行,闪亮的,,,,DT
链接 CPP11
建议 Zellkonverter,,,,Singlecellexperiment,,,,HDF5Array,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试(> = 3.0.0),嘲弄
系统要求 C ++ 14
增强
URL
取决于我
进口我 uniprot.ws
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cellxgenedp_1.0.1.tar.gz
Windows二进制 cellxgenedp_1.0.1.1.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) CellXgenedp_1.0.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellxgenedp
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cellxgenedp
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cellxgenedp/
软件包下载报告 下载统计
Bioc 3.15的旧源软件包 来源存档

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