生物导体版本:版本(3.15)
CellXgene数据门户(https://cellxgene.cziscience.com/)提供了一个图形用户界面,以通过标准方式处理的单细胞序列数据的集合来“计数矩阵”摘要。CellXgenedP软件包提供了一个基于R的替代性信息,允许数据发现,查看和下载。
作者:马丁·摩根[AUT,CRE],Kayla Interdonato [AUT],Daniel Parker [AUT,CPH](JSONCONS C ++图书馆创建者)
维护者:Martin Morgan
引用(从r内,输入引用(“ CellXgenedp”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ cellxgenedp”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ CellXgenedp”)
html | R脚本 | 从CellXgene数据门户发现并下载数据集和文件 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.0.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.15(R-4.2)(<6个月) |
执照 | Artistic-2.0 |BSL-1.0 |文件执照 |
要看 | |
进口 | dplyr,,,,httr,,,,卷曲,,,,jsonlite,utils,工具,并行,闪亮的,,,,DT |
链接 | CPP11 |
建议 | Zellkonverter,,,,Singlecellexperiment,,,,HDF5Array,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试(> = 3.0.0),嘲弄 |
系统要求 | C ++ 14 |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | uniprot.ws |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | cellxgenedp_1.0.1.tar.gz |
Windows二进制 | cellxgenedp_1.0.1.1.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | CellXgenedp_1.0.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellxgenedp |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/cellxgenedp |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/cellxgenedp/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
Bioc 3.15的旧源软件包 | 来源存档 |
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