Chromvar.

DOI：10.18129 / b9.bioc.chromvar.

染色质跨区域的变化

Bioconductor版本：释放（3.13）

确定横跨注释或峰的染色质可接近性的变化。例如，设计用于单细胞或稀疏染色质的可访问性数据，例如，来自Scatac-SEQ或稀疏散装ATAC或DNase-SEQ实验。

作者：Alicia Schep [Aut，Cre]，Jason Buenrostro [CTB]，Caleb Lareau [CTB]，William Greenleaf [Ths]，Stanford大学[CPH]

维护者：alicia schep

安装

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if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“chromvar”）

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文件

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细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.14.0
在生物导体中以来	BIOC 3.6（R-3.4）（3.5岁）
执照	mit +文件执照
依靠	r（> = 3.4）
进口	绞喉那Genomeinfodb.那Genomicranges.那ggplot2.那nabor.那生物相投那生物根系那生物仪器那TFBStools.那RSAMTOOLS.那S4Vectors.， 方法，rcpp.， 网格，情节那闪亮的那miniui.，统计数据，实用程序，图形，DT.那RTSNE.那矩阵那概括分析那rcolorbrewer.那bsgenome.
链接到	rcpp.那rcpparmadillo
建议	jaspar2016那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.那读书那testthat.那kn那RAMAMAMDOW.那Pheatmap.那motifmatchr.
系统要求	C ++ 11.
加强
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建议我	signac.
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	chromvar_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件	chromvar_1.14.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	chromvar_1.14.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/chromvar.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/ chromvar
包短网址	https://biocumon.org/packages/chromvar/
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