铬星座

DOI:10.18129 / b9.bioc.chromstar.

CHIP-SEQ数据组合和差分染色质状态分析

Bioconductor版本:释放(3.13)

该包实现芯片-SEQ数据组合和差分分析的功能。它包括UNI和多变量峰值呼叫,导出到基因组浏览器可视文件,以及用于富集分析的功能。

作者:Aaron Taudt,Maria Colome Tatche,Matthias Heinig,Minh Anh Nguyen

维护者:Aaron Taudt

引文(从R内,输入引文(“Chromstar”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“chromstar”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

Browsevignettes(“Chromstar”)

PDF. r script. ChromStar用户指南
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.18.0
在生物导体中以来 BIOC 3.4(R-3.3)(4.5岁)
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 3.3),Genomicranges.ggplot2.Chromstardata.
进口 方法,Utils,Grdevices,图形,统计数据,Foreach.多达齐全生物根系(> = 0.31.6),S4Vectors.genomeinfodb.绞喉重塑2.RSAMTOOLS.基因管理Bamsignals.mvtnorm.
链接到
建议 kn生物焦testthat.生物雕
系统要求
加强
URL. https://github.com/ataudt/chromstar.
Bugreports. https://github.com/ataudt/chromstar/issues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 chromstar_1.18.0.tar.gz.
Windows二进制文件 chromstar_1.18.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) chromstar_1.18.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/chromstar.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/ Chromstar
包短网址 https://biocumon.org/packages/chromstar/
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  • Bioc-devel.邮件列表 - 适用于包开发人员2021欧洲杯体育投注开户