Circrnaprofiler

doi：10.18129/b9.bioc.circrnaprofiler

Circrnaprofiler：基于R的计算框架，用于圆形RNA的下游分析

生物导体版本：版本（3.12）

基于R的计算框架，用于全面的CIRCRNA分析。该计算框架允许结合和分析先前通过多个基于公开注释的CIRCRNA检测工具检测到的CIRCRNA。它涵盖了来自差异表达分析，进化保护，生物发生到功能分析的不同方面。

作者：Simona Aufiero

维护者：gmail.com上的Simona Aufiero

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ circrnaprofiler”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ circrnaprofiler”）

html	R脚本	Circrnaprofiler
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.4.0
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（1。5年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.0.0）
进口	dplyr，，，，马格里特，，，，readr，，，，rtracklayer，，，，Stringr，，，，Stringi，，，，deseq2，，，，EDGER，，，，基因组机，，，，iranges，，，，seqinr，，，，r.utils，，，，RESHAPE2，，，，GGPLOT2，utils，rlang，，，，S4VECTORS，统计GenomeInfodB，，，，Universalmotif，，，，AnnotationHub，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，生物弦，，，，Gwascat，，，，BSGENOME
链接
建议	测试，，，，尼特，，，，roxygen2，，，，rmarkDown，citr，DevTools，，，，栅格，，，，ggpubr，，，，Venndiagram，，，，bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38，，，，bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10，，，，生物管理器
系统要求
增强
URL	https://github.com/aufiero/circrnaprofiler
BugReports	https://github.com/aufiero/circrnaprofiler/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	circrnaprofiler_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	circrnaprofiler_1.4.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	circrnaprofiler_1.4.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/circrnaprofiler
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/circrnaprofiler
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/circrnaprofiler/
软件包下载报告	下载统计