Cleanupdtseq.

DOI：10.18129 / b9.bioc.cleanupdtseq.

Cleanupdtseq清除来自寡聚蛋白（DT）介导的3'末端RNA汇流数据的聚酰基化位点的伪影

Bioconductor版本：释放（3.13）

该包装实现了一种朴素的贝叶斯分类器，用于通过过滤除了假聚腺苷酸化位点，从寡聚（DT）介导的3'结束测序，诸如PAS-SEQ，PolyA-SEQ和RNA-SEQ的真正聚腺苷酸化位点（PA位点），主要是由于在逆转录中寡核苷酸（DT）介导的内部灌注。分类器是高度准确的，优于其他启发式方法。

作者：萨拉·谢泼德，海博刘，建红欧，弥敦劳·劳森，李华·朱莉朱

维护者：建红欧<建红势。杜克，努>;Lihua Julie Zhu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“cleanupdtseq”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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HTML.	r script.	Cleanupdtseq小插图
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细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.30.0.
在生物导体中以来	BIOC 2.13（R-3.0）（7.5岁）
执照	GPL-2
依靠	r（> = 3.5.0），bsgenome.drerio.ucsc.danrer7.， 方法
进口	bsgenome.那Genomicranges.那Seqinr.那E1071.那生物仪器那Genomeinfodb.那绞喉，实用，stringr.，统计数据
链接到
建议	生物焦那RAMAMAMDOW.那kn那运行那生物根系（> = 0.1.0）
系统要求
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取决于我
进口我	inpas.
建议我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	cleanupdtseq_1.30.0.tar.gz.
Windows二进制文件	cleanupdtseq_1.30.0.0.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	cleanupdtseq_1.30.0.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/cleanupdtseq.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/清理程序
包短网址	https://biocumon.org/packages/cleanupdtseq/
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