簇发酵

doi：10.18129/b9.bioc.clusterexperiment

比较单细胞测序的聚类

生物导体版本：版本（3.12）

提供了运行和比较单细胞测序数据或其他大型mRNA表达数据集的许多不同聚类的功能。

作者：Elizabeth Purdom [AUT，CRE，CPH]，Davide Risso [aut]

维护者：Elizabeth Purdom

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ clusterexperiment”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ clusterexperiment”）

html	R脚本	簇状插图
html	R脚本	使用大型数据集
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	2.10.0
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（4。5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.6.0），Singlecellexperiment，，，，总结性特征（> = 1.15.4），生物基因
进口	方法，NMF，，，，rcolorbrewer，，，，猿（> = 5.0），簇，统计林玛，，，，多少，，，，locfdr，，，，矩阵，图形，并行，rspectra，，，，克恩拉布，，，，Stringr，，，，S4VECTORS，grdevices，延迟（> = 0.7.48），HDF5Array（> = 1.7.10），矩阵，，，，RCPP，，，，EDGER，，，，秤，，，，Zinbwave，，，，门酶，，，，pracma，，，，mbkmeans
链接	RCPP
建议	生物使用，，，，尼特，，，，测试，，，，桅杆，，，，RTSNE，，，，斯克兰，，，，Igraph
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/epurdom/clusterexperiment/issues
取决于我	NetSmooth
进口我	netdx
建议我	弹弓，，，，Tradeseq
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	clusterexperiment_2.10.0.tar.gz
Windows二进制	clusterexperiment_2.10.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	clusterexperiment_2.10.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clusterexperiment
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/clusterexperiment
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/clusterexperiment/
软件包下载报告	下载统计