生物导体版本:版本(3.15)
该软件包实现了CN.FARMS算法的拷贝数变化(CNV)分析。CN.FARMS允许分析最常见的Affymetrix(250K-SNP6.0)阵列类型,支持使用雪和FF的高性能计算。
作者:Andreas Mitterecker,Djork-Arne Clevert
维护者:Andreas Mitterecker
引用(从r内,输入引用(“ CN.Farms”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ CN.Farms”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ CN.Farms”)
R脚本 | CN.Farms:R包的手册 | |
参考手册 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.44.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.8(R-2.13)(11年) |
执照 | LGPL(> = 2.0) |
要看 | r(> = 3.0),生物酶, 方法,ff,,,,寡群,,,,雪 |
进口 | DBI,,,,affxparser,,,,奥利戈,,,,DNACOPIGY,,,,预处理,,,,格子 |
链接 | |
建议 | pd.mapping250k.Sty,,,,pd.mapping250k.nsp,,,,pd.Genomewidenp.5,,,,pd.Genomewidenp.6 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.bioinf.jku.at/software/cnfarms/cnfarms.html |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | cn.farms_1.44.0.tar.gz |
Windows二进制 | cn.farms_1.44.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | cn.farms_1.44.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cn.farms |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/cn.farms |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/cn.farms/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
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