compEpiTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.compEpiTools

计算表观基因组学的工具

Bioconductor版本:发行版(3.13)

计算表观基因组学工具的开发是为了在多个样本中跨多个基因组区域的各种(epi)基因组数据类型的分析、整合和同步可视化。

作者:Mattia Pelizzola [aut]， Kamal Kishore [aut, cre]

维护者:Kamal Kishore < Kamal。Fartiyal84在gmail.com>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" compepitols ")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“compEpiTools”)

PDF	R脚本	compEpiTools.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.26.0
在Bioconductor公司	bio 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证	GPL
取决于	R(>= 3.1.1)，方法，topGO，GenomicRanges
进口	AnnotationDbi，BiocGenerics，Biostrings，Rsamtools， parallel, grDevices，gplots，IRanges，GenomicFeatures，XVector，methylPipe，GO.db，S4Vectors，GenomeInfoDb
链接
建议	BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene，org.Mm.eg.db，knitr，rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	compEpiTools_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	compEpiTools_1.26.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	compEpiTools_1.26.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/compEpiTools
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/compEpiTools
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/compEpiTools/
软件包下载报告	下载数据