compcoder

doi：10.18129/b9.bioc.compcoder

RNASEQ数据模拟，差异表达分析和差异表达方法的性能比较

生物导体版本：版本（3.12）

该软件包提供了广泛的功能，用于比较通过不同方法获得的结果进行RNASEQ数据的差异表达分析。它还包含用于模拟计数数据的函数。最后，它为多个软件包提供了方便的接口，用于执行差异表达分析。这些也可以用作模板在包装框架内设置和运行用户定义的差分分析工作流程。

作者：Charlotte Soneson [Aut，CRE]

维护者：charlotte soneson

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ compcoder”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ compcoder”）

html	R脚本	compcoder
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.26.1
在生物导体中	Bioc 2.14（R-3.1）（7年）
执照	GPL（> = 2）
要看	SM
进口	TCLTK，尼特（> = 1.2），降价，，，，rocr，，，，格子（> = 0.16），GPLOTS，，，，gtools，，，，gdata，，，，表情， 网格，克恩斯门茶，，，，大量的，，，，GGPLOT2，，，，Stringr，，，，最模式，，，，EDGER，，，，林玛，，，，vioplot，方法，utils，统计，grdevices，图形
链接
建议	生物使用，，，，EBSEQ，，，，deseq2（> = 1.1.31），贝塞克（> = 2.2.0），GeneFilter，，，，Noingsq，，，，TCC，，，，NBPSEQ（> = 0.3.0），rmarkDown，，，，测试
系统要求
增强	rpanel，，，，DSS
URL	https://github.com/csoneson/compcoder
BugReports	https://github.com/csoneson/compcoder/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	compcoder_1.26.1.tar.gz
Windows二进制	compcoder_1.26.1.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	compcoder_1.26.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compcoder
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/compcoder
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/compcoder/
软件包下载报告	下载统计
Bioc 3.12的旧源软件包	来源存档