Bioconductor版本:Release (3.15)
这个包封装了许多函数来进行微分拓扑分析。它侧重于分析具有多个条件的“omic数据集”。虽然这个包主要面向scRNASeq,但它对实际的输入格式没有任何限制。
作者:Hector Roux de Bezieux [aut, cre], Koen Van den Berge [aut, ctb], Kelly Street [aut, ctb]
维护者:Hector Roux de Bezieux < Hector。Rouxdebezieux在berkeley.edu>
引文(从R内,输入引用(“调味品”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“调味品”)
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参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | R (>= 4.0) |
进口 | 弹弓(> = 1.9),mgcv,RANN统计数据,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment跑龙套,magrittr,dplyr(> = 1.0),Ecume(>= 0.9.1),方法pbapply,matrixStats,BiocParallel,TrajectoryUtils,igraph,截然不同的 |
链接 | |
建议 | knitr,testthat,rmarkdown,covr,冬青,ggplot2,RColorBrewer,randomForest,tidyr,TSCAN |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://hectorrdb.github.io/condiments/index.html |
BugReports | https://github.com/HectorRDB/condiments/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | condiments_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | condiments_1.4.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | condiments_1.4.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/condiments |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:包/调味品 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/condiments/ |
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