共识

doi：10.18129/b9.bioc.consensusov

基于基因表达的高级浆液卵巢癌的亚型分类

生物导体版本：版本（3.15）

该软件包实现了Helland等人描述的高级浆液（HGS）卵巢癌的四个主要亚型分类器。（PLOS One，2011），Bentink等。（Plos One，2012），Verhaak等。（J Clin Invest，2013年）和Konecny等。（J NATL癌症研究所，2014年）。此外，该软件包实现了共识分类器，该分类器巩固并改善了拟议的亚型分类器的鲁棒性，从而提供了明确定义的亚型的HGS卵巢肿瘤患者的可靠分层。

作者：Gregory M Chen，Lavanya Kannan，Ludwig Geistlinger，Victor Kofia，Levi Waldron，Benjamin Haibe-Kains

维护者：本杰明·海布·卡因斯

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ ConsenSusov”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“共识”）

html	R脚本	分子亚型用于卵巢癌
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.18.0
在生物导体中	Bioc 3.6（R-3.4）（5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.6）
进口	生物酶，，，，GSVA，，，，gdata，，，，Genefu，，，，林玛，，，，矩阵，，，，Randomforest，统计，utils，方法
链接
建议	生物使用，，，，GGPLOT2，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	http://www.pmgenomics.ca/bhklab/software/consensusov
BugReports	https://github.com/bhklab/consensusov/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	CONSENSUSOV_1.18.0.TAR.GZ
Windows二进制	CONSENSUSOV_1.18.0.ZIP
MacOS 10.13（高山脉）	CONSENSUSOV_1.18.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/consensusov
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/共识
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/consensusov/
软件包下载报告	下载统计