cont

DOI：10.18129 / b9.bioc.contibait.

使用Strand-SEQ数据改善早期构建基因组组件

Bioconductor版本：释放（3.13）

使用来自多个单个小区的来自多个单个细胞的基因组被组装的有机体，Contibait可以将杂交的染色体聚集在一起，并命令这些染色体内的褶皱。

作者：Kieran O'Neill，Mark Hills，Mike Gottliebb

维护者：Kieran O'Neill

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“contibait”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“Contibait”）

PDF.	r script.	flowbi.
PDF.		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.20.0
在生物导体中以来	BIOC 3.3（R-3.3）（5年）
执照	bsd_2_clause +文件执照
依靠	BH.（> = 1.51.0-3），RSAMTOOLS.（> = 1.21）
进口	data.table.，grdevices，线索那簇那贡献那生物根系（> = 0.31.6），S4Vectors.那绞喉那Genomicranges.那rcpp.那TSP.那基因组夫妇那GTOOLS.那rtracklayer.那生物相投那dnacopy.那色彩空间那重塑2.那ggplot2.， 方法，exoMecopy.那基因管理那图表
链接到	rcpp.那BH.
建议	生物焦
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	contibait_1.20.0.tar.gz.
Windows二进制文件	contibait_1.20.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	contibait_1.20.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/contibait.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/环
包短网址	https://biocumon.org/packages/contibait/
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