Conumee

doi:10.18129/b9.bioc.conumee

使用Illumina DNA甲基化阵列增强的拷贝数变化分析

生物导体版本:版本(3.13)

该软件包包含一组使用Illumina 450K或Epic甲基化阵列执行拷贝数变化(CNV)分析的处理和绘图方法。

作者:Marc Zapatka的Volker Hovestadt

维护者:Hovestadt.bio>的Volker Hovestadt

引用(从r内,输入引用(“ Conumee”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ conumee”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Conumee”)

html R脚本 Conumee
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.26.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(6年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.0),Minfi,,,,Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19,,,,Illuminahumanmethylation450Kmanifest,,,,Illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19,,,,光照明甲基甲基化epicmanifest
进口 方法,统计,DNACOPIGY,,,,rtracklayer,,,,基因组机,,,,iranges,,,,GenomeInfodB
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,Minfidata,,,,rcurl
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 CoperNeutralima
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Conumee_1.26.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉) Conumee_1.26.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/conumee
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/conumee
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/conumee/
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