生物导体版本:版本(3.15)
通过流式细胞仪和细胞复杂性信息测量的所有颗粒中过滤和/或识别浮游植物细胞的方法。它使用一维通道上的一维门序列来实现此操作,以测量某些色素沉着和复杂性。该包装特别针对蓝细菌进行调整,但对于浮游植物社区的工作良好,至少有一个细胞特征可以区分社区中的每个浮游植物。
作者:Oluwafemi Olusoji [Cre,Aut],Aerts Marc [CTB],Delaender Frederik [CTB],Neyens Thomas [CTB],Spaak Jurg [aut]
维护者:oluwafemi olusoji
引用(从r内,输入引用(“蓝滤器”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Cyanofilter”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Cyanofter”)
html | R脚本 | 蓝滤器:一个半自动化框架,用于识别流式细胞术中的植物浮游生物和蓝细菌种群 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.13(R-4.1)(1年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 4.1.0) |
进口 | 生物酶,,,,流核,,,,流量密度,,,,flowclust,,,,细胞仪,,,,GGPLOT2,,,,ggally,图形,grdevices,方法,mrfdepth,统计,utils |
链接 | |
建议 | 马格里特,,,,dplyr,,,,purrr,,,,尼特,,,,Stringr,,,,rmarkDown,,,,花花公子 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/fomotis/cyanofilter |
BugReports | https://github.com/fomotis/cyanofilter/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Cyanofilter_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | CYANOFILTER_1.4.0.ZIP |
MacOS 10.13(高山脉) | CYANOFILTER_1.4.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cyanofilter |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/蓝滤器 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/cyanofilter/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
文档»
生物导体