蓝滤器

doi:10.18129/b9.bioc.Cyanofter

使用细胞色素沉着和/或复杂性的浮游植物种群鉴定

生物导体版本:版本(3.15)

通过流式细胞仪和细胞复杂性信息测量的所有颗粒中过滤和/或识别浮游植物细胞的方法。它使用一维通道上的一维门序列来实现此操作,以测量某些色素沉着和复杂性。该包装特别针对蓝细菌进行调整,但对于浮游植物社区的工作良好,至少有一个细胞特征可以区分社区中的每个浮游植物。

作者:Oluwafemi Olusoji [Cre,Aut],Aerts Marc [CTB],Delaender Frederik [CTB],Neyens Thomas [CTB],Spaak Jurg [aut]

维护者:oluwafemi olusoji

引用(从r内,输入引用(“蓝滤器”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Cyanofilter”)

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文档

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Browsevignettes(“ Cyanofter”)

html R脚本 蓝滤器:一个半自动化框架,用于识别流式细胞术中的植物浮游生物和蓝细菌种群
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细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.13(R-4.1)(1年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 4.1.0)
进口 生物酶,,,,流核,,,,流量密度,,,,flowclust,,,,细胞仪,,,,GGPLOT2,,,,ggally,图形,grdevices,方法,mrfdepth,统计,utils
链接
建议 马格里特,,,,dplyr,,,,purrr,,,,尼特,,,,Stringr,,,,rmarkDown,,,,花花公子
系统要求
增强
URL https://github.com/fomotis/cyanofilter
BugReports https://github.com/fomotis/cyanofilter/issues
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包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Cyanofilter_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 CYANOFILTER_1.4.0.ZIP
MacOS 10.13(高山脉) CYANOFILTER_1.4.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cyanofilter
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/蓝滤器
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cyanofilter/
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