dasper

DOI:10.18129 / B9.bioc.dasper

从rna测序数据中检测异常剪接事件

生物导体版本:发布(3.13)

dasper的目的是从RNA-seq数据中检测异常剪接事件。dasper将使用作为输入连接和覆盖数据从RNA-seq计算每个拼接事件的偏差从一组用户定义的控制。Dasper使用一种无监督的离群值检测算法对患者的每个拼接事件进行评分，其中离群值表示该拼接事件看起来异常的程度。

作者:David Zhang， Leonardo Collado-Torres

维护者:张大卫<张大卫。12在ucl.ac.uk >

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细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0)
进口	蛇怪,BiocFileCache,BiocParallel,data.table,dplyr,GenomeInfoDb,GenomicFeatures,GenomicRanges,IRanges,magrittr,megadepth、方法、plyranges,readr,网状,S4Vectors,stringr,SummarizedExperiment,tidyr
链接
建议	BiocStyle,covr,testthat,GenomicState,ggplot2,ggpubr,ggrepel、网格knitcitations,knitr,重新计票,rmarkdown,sessioninfo,rtracklayer,宠物猫
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/dzhang32/dasper
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/dasper
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包档案

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源包	dasper_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	dasper_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	dasper_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dasper
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ dasper
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/dasper/
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