dearseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.dearseq

通过稳健方差分量检验对RNA-seq数据进行差异表达分析

Bioconductor版本:发行版(3.12)

差异表达分析RNA-seq数据用方差分量评分检验通过精确权重计算数据异方差。执行基因和基因集分析,并能处理重复或纵向数据。方法详见Agniel D & Hejblum BP(2017)纵向RNA-seq数据的时间过程基因集分析方差成分评分检验,生物统计学,18(4):589-604。Gauthier M, Agniel D, Thiébaut R & Hejblum BP(2019)。dearseq:用于RNA-Seq差分分析的方差分量得分检验,有效控制错误发现率*bioRxiv* 635714。

作者:Denis Agniel [aut], Boris P. Hejblum [aut, cre], Marine Gauthier [aut]

维护者:Boris P. Hejblum < Boris。Hejblum at u-bordeaux.fr>

引用(从R中,输入引用(“dearseq”)):

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版本 1.2.0
在Bioconductor公司 BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证 GPL-2 |文件许可证
取决于 R (>= 3.6.0)
进口 CompQuadFormggplot2KernSmoothmatrixStats方法,并行,pbapply统计数据,statmod
链接
建议 BiobaseBiocManagerBiocSet刨边机DESeq2GEOqueryGSAknitrlimmareadxlrmarkdownS4VectorsSummarizedExperimenttestthatcovr
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源包 dearseq_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 dearseq_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) dearseq_1.2.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dearseq
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/dearseq
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/dearseq/
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