德布雷斯勒

DOI:10.18129 / b9.bioc.debrowser.

交互式差分expresion分析浏览器

Biocometiond版本:释放(3.12)

生物信息学平台,含有交互图和表表的差异基因和区域表达研究。允许以交互式和更快的方式更深刻地深入地可视化表达数据。通过更改参数,用户可以轻松发现之前从未完成的数据的不同部分。手动创建和寻找这些图需要时间。戴布雷尔用户可以在不编写任何代码的情况下准备绘图。在现场进行差异表达,PCA和聚类分析,结果显示在各种图中,如散射,棒,箱,火山,MA图和热带。

作者:Alper Kucukural ,Onur Yukselen ,Manuel Garber

维护者:Alper Kucukural

引文(从R内,输入引文(“DeBrowser”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“debrowser”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“DEBROWSER”)

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细节

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版本 1.18.2
在生物导体中以来 BIOC 3.3(R-3.3)(4.5岁)
执照 gpl-3 +文件执照
依靠 r(> = 3.5.0)
进口 闪亮的雅思石Shinyjs.ShinydashboardShinybs.贡献DT.ggplot2.rcolorbrewer.注释annotationdbi.deseq2.剂量iGraph.,grdevices,图形,统计数据,utils,Genomicranges.绞喉S4Vectors.概括分析stringi.重塑2.org.hs.eg.db.org.mm.eg.db.林马edger.ClusterProfiler., 方法,SVA.rcurl.纪念碑Colourpicker.情节热克服哈曼Pathview.apeglm.ashr.
链接到
建议 testthat.RAMAMAMDOW.knr.rsp.
系统要求
加强
URL. https://github.com/umms-biocore/debrowser.
Bugreports. https://github.com/umms-biocore/debrowser/issues/new.
取决于我
进口我
建议我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 debrowser_1.18.2.tar.gz.
Windows二进制文件 debrowser_1.18.2.zip.
Macos 10.13(高塞拉) debrowser_1.18.2.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/debrowser.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/德布罗斯
包短网址 https://biocumon.org/packages/debrowser/
包裹下载报告 下载统计信息
BIOC 3.12的旧源包 源档案

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

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  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • Bioc-devel.邮件列表 - 适用于包开发人员2021欧洲杯体育投注开户