Decontam

doi：10.18129/b9.bioc.decontam

识别标记 - 基因和宏基因组学测序数据中的污染物

生物导体版本：版本（3.15）

简单地识别标记或宏基因组学数据中污染序列特征。从环境测序数据（例如ASV，OTU，分类组，MAGS等）中得出的任何形式的功能。需要DNA定量数据或测序的阴性对照样品。

作者：本杰明·卡拉汉（Benjamin Callahan）[AUT，CRE]，Nicole Marie Davis [AUT]，Felix G.M.恩斯特[CTB]

维护者：本杰明·卡拉汉（Benjamin Callahan）

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ decontam”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Decontam”）

html	R脚本	Dada2简介
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.16.0
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（4年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.4.1），方法（> = 3.4.1）
进口	GGPLOT2（> = 2.1.0），RESHAPE2（> = 1.4.1），统计
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，门索
系统要求
增强
URL	https://github.com/benjjneb/decontam
BugReports	https://github.com/benjjneb/decontam/issues
取决于我
进口我	米娅
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	decontam_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	decontam_1.16.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	decontam_1.16.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/decontam
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/decontam
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/decontam/
软件包下载报告	下载统计