- 家
- Biocumon 3.12.
- 软件包
- deltacapturec
deltacapturec
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI：10.18129 / b9.bioc.deltacapturec
该包裹发现了从3C数据中重塑的中学级染色质重塑
Biocometiond版本：释放（3.12）
该包裹发现了从3C数据进行重塑的Meso级染色质。3C数据本质上是本地的。它会在限制酶消化片段和优选的“视点”区域之间给予相互作用计数。通过融合该数据并使用排列测试，该包可以测试来自两个小区类型或两种处理之间的数据之间的交互计数是否存在统计上显着的变化。
作者：Michael Shapiro [Aut，CRE]
维护者：Michael Shapiro
引文（从R内，输入引文（“deltacapturec”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：
if（！quancenamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“deltacapturec”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“DELTACAPTUREC”）
| HTML. | r script. | Delta Capture-C |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
| 版本 | 1.4.0. |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.10（R-3.6）（1.5年） |
| 执照 | mit +文件执照 |
| 依靠 | r（> = 3.6） |
| 进口 | 绞喉那Genomicranges.那概括分析那ggplot2.那deseq2. |
| 链接到 | |
| 建议 | kn那RAMAMAMDOW. |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | deltacapturec_1.4.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | deltacapturec_1.4.0.zip. |
| Macos 10.13（高塞拉） | deltacapturec_1.4.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/deltacapturec |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包/ deltacapturec |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/deltacapturec/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
