diffcyt

DOI:10.18129 / B9.bioc.diffcyt

通过高分辨率聚类发现高维细胞术中的差异

生物导体版本:发布(3.12)

基于高分辨率聚类和转录组学经验贝叶斯调节测试的组合，用于高维细胞术数据差异发现分析的统计方法(包括流式细胞术、大量细胞术或CyTOF和寡核苷酸标记细胞术)。

作者:Lukas M. Weber [aut, cre]

维护者:Lukas M. Weber

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!require ("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("diffcyt")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“diffcyt”)

超文本标记语言	R脚本	diffcyt工作流
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (R-3.5)(3年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.4.0)
进口	flowCore,FlowSOM,SummarizedExperiment,S4Vectors,limma,刨边机,lme4,multcomp,dplyr,tidyr,reshape2,magrittr、stats、methods、utils、grDevices、graphics、ComplexHeatmap,circlize、网格
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,HDCytoData,催化剂
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lmweber/diffcyt
BugReports	https://github.com/lmweber/diffcyt/issues
取决于我	cytofWorkflow
进口我
建议我	催化剂,HDCytoData
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	diffcyt_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	diffcyt_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	diffcyt_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/diffcyt
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ diffcyt
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/diffcyt/
包下载报告	下载数据