生物导体版本:版本(3.15)
独特的是在两个或多个分布组之间进行差异测试的统计方法;差异测试是通过分层的非参数置换测试对每个样品的累积分布函数(CDF)进行的。虽然通过比较完整的CDF,鉴定涉及平均值变化的差异模式以及不涉及平均值的更微妙的变化(例如,单模态),但大多数条件之间平均丰度差异目标差异的方法,鉴定差异模式(例如与平均值相同的双模式分布。独特的是一种通用且灵活的工具:由于其完全非参数性质,这对数据的生成方式没有任何假设,因此可以应用于各种数据集。它特别适合对单细胞数据(即细胞中的亚种群中的差分分析)进行差异态分析,例如单细胞RNA测序(SCRNA-SEQ)和高维流量或质量细胞仪(HDCYTO)数据。使用不同的一个样品(即实验条件)的不同一个数据,每组至少有2个样本(即生物学重复)。
作者:Simone Tiberi [AUT,CRE]。
维护者:Simone Tiberi
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html | R脚本 | 独特的:通过层次排列测试进行差分分析的方法 |
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版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.11(R-4.0)(2年) |
执照 | GPL(> = 3) |
要看 | R(> = 4.0) |
进口 | RCPP,,,,rfast,统计总结性特征,,,,Singlecellexperiment, 方法,矩阵,,,,foreach, 平行,多帕尔,,,,Dorng,,,,GGPLOT2,,,,林玛,,,,评分 |
链接 | RCPP,,,,rcpparmadillo,,,,rfast |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,insctr |
系统要求 | C ++ 11 |
增强 | |
URL | https://github.com/simonetiberi/distinct |
BugReports | https://github.com/simonetiberi/distinct/issues |
取决于我 | |
进口我 | 调味品,,,,空间Heatmap |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
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源包 | dinters_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | dintict_1.8.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | DINSTINP_1.8.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/distinct |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/独特 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/distinct/ |
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