清楚的

doi:10.18129/b9.bioc.distinct

独特的:通过层次排列测试进行差分分析的方法

生物导体版本:版本(3.15)

独特的是在两个或多个分布组之间进行差异测试的统计方法;差异测试是通过分层的非参数置换测试对每个样品的累积分布函数(CDF)进行的。虽然通过比较完整的CDF,鉴定涉及平均值变化的差异模式以及不涉及平均值的更微妙的变化(例如,单模态),但大多数条件之间平均丰度差异目标差异的方法,鉴定差异模式(例如与平均值相同的双模式分布。独特的是一种通用且灵活的工具:由于其完全非参数性质,这对数据的生成方式没有任何假设,因此可以应用于各种数据集。它特别适合对单细胞数据(即细胞中的亚种群中的差分分析)进行差异态分析,例如单细胞RNA测序(SCRNA-SEQ)和高维流量或质量细胞仪(HDCYTO)数据。使用不同的一个样品(即实验条件)的不同一个数据,每组至少有2个样本(即生物学重复)。

作者:Simone Tiberi [AUT,CRE]。

维护者:Simone Tiberi

引用(从r内,输入引用(“独特”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ dimption”)

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文档

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版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(2年)
执照 GPL(> = 3)
要看 R(> = 4.0)
进口 RCPP,,,,rfast,统计总结性特征,,,,Singlecellexperiment, 方法,矩阵,,,,foreach, 平行,多帕尔,,,,Dorng,,,,GGPLOT2,,,,林玛,,,,评分
链接 RCPP,,,,rcpparmadillo,,,,rfast
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,insctr
系统要求 C ++ 11
增强
URL https://github.com/simonetiberi/distinct
BugReports https://github.com/simonetiberi/distinct/issues
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包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 dinters_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 dintict_1.8.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) DINSTINP_1.8.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/distinct
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/独特
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/distinct/
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