dittoseq.

DOI：10.18129 / b9.bioc.dittoseq.

用户友好的单细胞和散装RNA测序可视化

Biocometiond版本：释放（3.12）

普遍，用户友好，单细胞和批量RNA测序可视化工具包，其允许高度可定制的颜色失明友好，出版质量数字。Dittoseq通过转换为SceizedexPeriment或Dgelist批量数据，接受SingleCellexPeriment（SCE）和Seurat对象，以及进口和使用，以及概述的概要。可视化包括维度降低地块，热带，散点图，跨组的组成或表达等等。自定义范围从尺寸和标题调整到自动生成热量的注释，轨迹分析的覆盖层对任何维度的重建图，隐藏数据覆盖在光标上悬停在通过GGPLOT转换等等，还有更多。所有都有简单，离散的输入。颜色失明友好性由传奇调整（放大键）提供动力，并且除了仔细选择的dittocolors（）之外还可允许使用形状或字母覆盖。

作者：Daniel Bunis [Aut，Cre]，Jared Andrews [Aut，CTB]

维护者：Daniel Bunis

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！properenamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“dittoseq”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“Dittoseq”）

HTML.	r script.	注释SCRNA-SEQ数据
PDF.		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.2.3
在生物导体中以来	BIOC 3.11（R-4.0）（1年）
执照	mit +文件执照
依靠	ggplot2.
进口	方法，色彩空间（> = 1.4），格拉底那电台那重塑2.那Pheatmap.，grdevices，GGRepel.那格格里加，统计数据，utils，概括分析那SinglecellexPeriment.那edger.那S4Vectors.
链接到
建议	情节那testthat.那Seurat.（> = 2.2），deseq2.那ggplot.multistats.那kn那生物焦那scrnapeq.那吉拉斯特（> = 0.2.0），ComplexHeatMap.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我	逃脱那TidysinglecellexPeriment.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	dittoseq_1.2.3.tar.gz.
Windows二进制文件	dittoseq_1.2.3.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	dittoseq_1.2.3.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/dittoseq.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/ dittoseq
包短网址	https://biocumon.org/packages/dittoseq/
包裹下载报告	下载统计信息
BIOC 3.12的旧源包	源档案