DMRSEQ.

DOI：10.18129 / b9.bioc.dmrseq.

从全基因组亚硫酸氢盐测序中差异甲基化区的检测和推断

Bioconductor版本：释放（3.13）

该包装实现了一种扫描基因组以检测和对来自全基因组亚硫酸氢盐测序数据进行差异甲基化区域进行准确推理的方法。该方法基于将检测到的区域进行比较到汇集的空分布，即使只有每个群体的两个样本都可以来，也可以实现。通过将广义最小二乘（GLS）回归模型与嵌套的自回转相关误差结构拟合，以获得对转化的甲基化比例的影响而获得的区域级统计。

作者：凯瑞·克富豪[CRE，AUT]，Rafael Irtizarry [Aut]，Yuval Benjamini [Aut]，Sutirtha Chakraborty [Aut]

维护者：Keegan Korthauer

安装

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细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.12.0
在生物导体中以来	BIOC 3.7（R-3.5）（3年）
执照	mit +文件执照
依靠	r（> = 3.5），BSSeq.
进口	Genomicranges.那nlme.那ggplot2.那S4Vectors.那rcolorbrewer.那Bumphunter.那delayedmatrixstats（> = 1.1.13），MatrixStats.那生物相投那异常值， 方法，Locfit.那绞喉，grdevices，图形，统计数据，utils，annotatr.那annotationhub.那rtracklayer.那genomeinfodb.，花键
链接到
建议	kn那RAMAMAMDOW.那生物焦
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进口我	Biscuiteer.
建议我
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包档案包

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源包	dmrseq_1.12.0.tar.gz.
Windows二进制文件	dmrseq_1.12.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	dmrseq_1.12.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/dmrseq.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ DMRSEQ
包短网址	https://biocumon.org/packages/dmrseq/
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