辅修

DOI:10.18129 / b9.bioc.doser.

辅修

Biocometiond版本:释放(3.12)

剂量包是用于性染色体剂量补偿的下一代测序包,其可以广泛应用,以检测基因表达中的任意数量的预定鉴定基因组中的变化。剂量是计数数据的差异基因表达包,可检测多个特定基因子集的表达方向的定向变化,系统生物学研究中的广泛效用。DERER已经准备管理数据的性质和所需的推论集。DOSER使用S4类来存储来自测序实验的计数数据。它包含用于标准化和过滤计数数据的函数,以及绘制和计算计数数据的统计信息。它包含计数数据的线性建模的框架。该包已使用真实和模拟数据进行测试。

作者:AJ VAESTEMARK,JR WALTERS。

维护者:Ake.Vastermark

引文(从R内,输入引文(“装饰”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

if(!properenamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“doser”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“DESER”)

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细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.6.0
在生物导体中以来 BIOC 3.9(R-3.6)(1.5年)
执照 GPL.
依靠 r(> = 3.6)
进口 edger.,方法,统计数据,图形,MatrixStats.蒙链LME4.运行概括分析消化S4Vectors.
链接到
建议 生物焦knRAMAMAMDOW.
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加强
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 doser_1.6.0.tar.gz.
Windows二进制文件 doser_1.6.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) doser_1.6.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/doser.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/装饰
包短网址 https://biocumon.org/packages/doser/
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支持»

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  • Bioc-devel.邮件列表 - 适用于包开发人员2021欧洲杯体育投注开户