- 家
- Biocumon 3.13
- 软件包
- dpeak.
dpeak.
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DOI：10.18129 / b9.bioc.dpeak.
Dpeak（Chip-SEQ分析中峰的去卷积）
Bioconductor版本：释放（3.13）
Dpeak是使用PET和集芯片-SEQ和芯片-EXO数据的蛋白质-DNA相互作用位点的高分辨率鉴定的统计框架。它为计算芯片-SEQ和芯片-exo数据提供了计算上高效和用户友好的界面，实现了探索性分析，适合Dpeak模型以及用于下游分析的预测绑定站点的导出列表。
作者：东军涌，卡特艾伦
维护者：东晋忠九跑在Gmail.com>
引文（从R内，输入引文（“dpeak”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“dpeak”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“DPEAK”）
| PDF. | r script. | dpeak. |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
| 版本 | 1.4.0. |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.11（R-4.0）（1年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 依靠 | r（> = 4.0.0），方法，统计数据，Util，图形，rcpp. |
| 进口 | 大量的那绞喉那bsgenome.，格栅，并行 |
| 链接到 | rcpp. |
| 建议 | bsgenome.ecoli.ncbi.20080805. |
| 系统要求 | GNU制作，MEME，FIMO |
| 加强 | |
| URL. | |
| Bugreports. | https://github.com/dongjunchung/dpeak/issues. |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | dpeak_1.4.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | dpeak_1.4.0.zip. |
| Macos 10.13（高塞拉） | dpeak_1.4.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/dpeak. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包/ dpeak |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/dpeak/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
