Bioconductor版本:发布(3.15)
为小分子或基因/蛋白质标识符集的药物靶标相互作用提供实用工具。所需的药物-靶标相互作用信息从ChEMBL数据库的本地SQLite实例中获得。之所以选择ChEMBL,是因为它提供了公共领域中最全面、最好的药物靶标信息注释知识资源之一。
作者:托马斯·吉克[作家,作家]
维护者:托马斯·吉克<托马斯。网址ucr。edu>
引用(来自R,输入引用(“drugTargetInteractions”)
):
要安装这个包,启动R(版本"4.2")并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("drugTargetInteractions")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放。
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“drugTargetInteractions”)
超文本标记语言 | R脚本 | 药物相互作用 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor中 | BioC 3.13 (R-4.1)(1年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | 方法,R (>= 4.1) |
进口 | 跑龙套,RSQLite,UniProt.ws,biomaRt,ensembldb,BiocFileCache,dplyr,rappdirs,AnnotationFilter,S4Vectors |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocStyle,knitr,rmarkdown,ggplot2,reshape2,DT,EnsDb.Hsapiens.v86 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/girke-lab/drugTargetInteractions |
BugReports | https://github.com/girke-lab/drugTargetInteractions |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | drugTargetInteractions_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | drugTargetInteractions_1.4.0.zip(64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | drugTargetInteractions_1.4.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/drugTargetInteractions |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/drugTargetInteractions |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/drugTargetInteractions/ |
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