边缘

DOI:10.18129 / B9.bioc.edge

差异基因表达的提取

Bioconductor版本:发行版(3.12)

边缘包实现了用于进行全基因组基因表达研究的差异表达分析的方法。使用最佳发现程序和广义似然比检验(相当于f检验和t检验)对一般研究设计进行显著性检验。特殊功能可用于方便分析常见的研究设计，包括时间课程实验。edge还集成了其他包，如snm、sva和qvalue，为基因表达分析提供了广泛的工具。

作者:John D. Storey, Jeffrey T. Leek和Andrew J. Bass

维护者:John D. Storey ， Andrew J. Bass

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("edge")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“边缘”)

PDF	R脚本	包边
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	2.22.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.1.0)，Biobase
进口	方法、样条函数股东价值分析，球形结构，稻草人，qvalue(> = 1.99.0),质量
链接
建议	testthat，knitr，ggplot2，reshape2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jdstorey/edge
BugReports	https://github.com/jdstorey/edge/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	edge_2.22.0.tar.gz
Windows二进制	edge_2.22.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	edge_2.22.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/edge
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/edge
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/edge/
软件包下载报告	下载数据