Bioconductor版本:释放(3.13)
“EnRichplot”包装实现了几种可视化方法,用于解释从ORA或GSEA分析获得的功能性富集结果。所有可视化方法都是基于'GGPLOT2'图形开发的。
作者:广东宇[AUT,CRE],Erqiang Hu [CTB]
维护者:广东宇<广东峪在Gmail.com>
引文(从R内,输入引文(“Enrichplot”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“enreichplot”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“ENRICHPLOT”)
HTML. | 纪念碑 | |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.7(R-3.5)(3年) |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | r(> = 3.5.0) |
进口 | 电台那剂量(> = 3.16.0),ggplot2.那GGraph..,图形,网格,iGraph., 方法,普利尔那邮风那rcolorbrewer.那重塑2.,统计数据,utils,散射那ShadowText.那Gosemsim.那Magrittr.那GGTree. |
链接到 | |
建议 | ClusterProfiler.那dplyr.那Europepmc那ggupset.那kn那RAMAMAMDOW.那org.hs.eg.db.那prettydoc.那娇媚那Tidyr.那Ggforce.那annotationdbi.那ggplotify.那格格里加,grdevices,格拉底那GGNewScale那GGRepel.(> = 0.9.0),GGStar.那树木那秤那tidytree. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book//book// |
Bugreports. | https://github.com/guangchuangyu/enrichplot/issues. |
取决于我 | 牧师 |
进口我 | Chipseeker.那ClusterProfiler.那德布雷斯勒那exphuntersuite.那魔法杂色那网格那多态石那反弹 |
建议我 | 甲基葡萄酒 |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
源包 | enrichplot_1.12.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | enrichplot_1.12.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | enrichplot_1.12.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/enrichplot. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包/纪录 |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/enrichplot/ |
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