Epialleler

doi：10.18129/b9.bioc.epialleler

快速，乳脂能感知的甲基化报告基因

生物导体版本：版本（3.15）

上皮是特定的DNA甲基化模式，在有丝分裂和/或减数分裂上遗传。该软件包称使用二进制对齐图（BAM）文件作为输入，在基因组区域或单个细胞固体水平的高甲基化的上列频率或单个细胞频率上称为输入。其他功能包括提取甲基化模式，计算每个阅读β值的经验累积分布函数，并测试特定基因组位置（SNP）处的息脂甲基化状态与基本频率之间的关联的重要性。

作者：Oleksii Nikolaienko [AUT，CRE]

维护者：oleksii nikolaienko

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Epialleler”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Epialleler”）

html	R脚本	Epialleler
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.4.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 4.1）
进口	统计，方法，utils，基因组机，，，，生物基因，，，，GenomeInfodB，，，，总结性特征，，，，变体，，，，Stringi，，，，Data.Table
链接	RCPP，，，，BH，，，，Rhtslib，，，，Zlibbioc
建议	运行，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，GGPLOT2，，，，GGSTANCE
系统要求	C ++ 17，GNU制作
增强
URL	https://github.com/bbcg/epialleler
BugReports	https://github.com/bbcg/epialleler/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	epialleler_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	epialleler_1.4.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	epialleler_1.4.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epialleler
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/epialleler
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/epialleler/
软件包下载报告	下载统计