逃脱

doi:10.18129/b9.bioc.escape

简单的单细胞分析平台用于丰富

生物导体版本:版本(3.15)

在单细胞RNA测序的背景下,一个促进基因集富集分析(GSEA)的桥接r包装。使用原始计数信息,seurat对象或单旋转Perfermiment格式,用户可以在各个单元格之间执行和可视化GSEA。

作者:Nick Borcherding [AUT,CRE],Jared Andrews [AUT]

维护者:nick borcherding

引用(从r内,输入引用(“逃脱”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“逃脱”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“逃脱”)

html R脚本 逃脱托托克
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文本 消息

细节

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版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 4.1)
进口 grdevices,dplyr,,,,GGPLOT2,,,,gseabase,,,,GSVA,,,,Singlecellexperiment,,,,Ggridges,,,,msigdbr,统计生物比较,,,,矩阵,,,,Ucell,,,,扫帚,,,,RESHAPE2,,,,拼布,,,,矩阵,utils,rlang,,,,Stringr,,,,Data.Table,,,,总结性特征, 方法
链接
建议 Seurat,,,,seuratObject,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,降价,,,,生物使用,,,,测试,,,,Dittoseq(> = 1.1.2)
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 CEPO
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Escape_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 Escape_1.6.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) Escape_1.6.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/escape
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/逃生
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/escape/
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