生物导体版本:版本(3.15)
在单细胞RNA测序的背景下,一个促进基因集富集分析(GSEA)的桥接r包装。使用原始计数信息,seurat对象或单旋转Perfermiment格式,用户可以在各个单元格之间执行和可视化GSEA。
作者:Nick Borcherding [AUT,CRE],Jared Andrews [AUT]
维护者:nick borcherding
引用(从r内,输入引用(“逃脱”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“逃脱”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“逃脱”)
html | R脚本 | 逃脱托托克 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | R(> = 4.1) |
进口 | grdevices,dplyr,,,,GGPLOT2,,,,gseabase,,,,GSVA,,,,Singlecellexperiment,,,,Ggridges,,,,msigdbr,统计生物比较,,,,矩阵,,,,Ucell,,,,扫帚,,,,RESHAPE2,,,,拼布,,,,矩阵,utils,rlang,,,,Stringr,,,,Data.Table,,,,总结性特征, 方法 |
链接 | |
建议 | Seurat,,,,seuratObject,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,降价,,,,生物使用,,,,测试,,,,Dittoseq(> = 1.1.2) |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | CEPO |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Escape_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | Escape_1.6.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | Escape_1.6.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/escape |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/逃生 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/escape/ |
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