FlowWorkspace

doi:10.18129/b9.bioc.flowworkspace

用于表示和与未经测度的细胞仪数据集和相互作用的基础架构。

生物导体版本:版本(3.15)

该软件包旨在促进自动门控方法与FlowJo中完成的手动门控的比较。该软件包允许您将基本的Flowjo工作区导入生物通用器,并使用FlowCore功能从FlowJo复制门控。进行门控层次结构,样本组,补偿和转换,以使输出与FlowJo分析匹配。

作者:格雷格·芬克(Greg Finak),迈克·江(Mike Jiang)

维护者:Greg Finak ,Mike Jiang

引用(从r内,输入引用(“流动空间”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ FlowWorkspace”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

BrowseVignettes(“ FlowWorkspace”)

html R脚本 FlowWorkspace简介:存储和操纵门控流数据的包
html R脚本 如何合并Gatingsets
PDF 参考手册
文本 消息
文本 安装
文本 执照

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 4.8.0
在生物导体中 Bioc 2.9(R-2.14)(10。5年)
执照 文件执照
要看 R(> = 3.5.0)
进口 生物酶,,,,生物基因,,,,Cytolib(> = 2.3.9),格子,,,,LatticeExtra,,,,XML,,,,GGPLOT2,,,,图形,图形,grdevices,方法,统计,Stats4,utils,rbgl, 工具,rgraphviz,,,,Data.Table,,,,dplyr,,,,RCPP,,,,,,,,矩阵,,,,rcppparallel,,,,rprotobuflib,,,,消化,,,,aws.s3,,,,aws.signature,,,,流核(> = 2.1.1),ncdfflow(> = 2.25.4),延迟,,,,S4VECTORS
链接 RCPP,,,,BH(> = 1.62.0-1),rprotobuflib(> = 1.99.4),Cytolib(> = 2.3.7),Rhdf5lib,,,,rcpparmadillo,,,,rcppparallel(> = 4.4.2-1)
建议 测试,,,,FlowWorkspacedata(> = 2.23.2),尼特,,,,rmarkDown,,,,ggcyto, 平行,细胞瘤,,,,opencyto
系统要求 GNU MAKE,C ++ 11
增强
URL
取决于我 ggcyto,,,,高通量库
进口我 细胞瘤,,,,流量密度,,,,流动,,,,FlowStats,,,,免疫空间,,,,opencyto,,,,PEACOQC
建议我 催化剂,,,,罗盘,,,,flowclust,,,,流核
链接到我 细胞瘤
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 FlowWorkSpace_4.8.0.tar.gz
Windows二进制 FlowWorkSpace_4.8.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) FlowWorkSpace_4.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowworkspace
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:套餐/flowworkspace
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/flowworkspace/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户