gcrisprtools

doi:10.18129/b9.bioc.gcrisprtools

合并CRISPR屏幕QC和分析的功能套件

生物导体版本:版本(3.12)

一组用于评估汇总高通量筛查实验的工具,通常采用CRISPR/CAS9或SHRNA表达盒。包含在实验中询问库和盒式行为的方法,识别差异丰富的盒式录音带,汇总信号以识别候选目标的经验验证,假设测试和全面报告。

作者:罗素·贝纳尔(Russell Bainer),达里乌斯·拉特曼(Dariusz Ratman),史蒂夫·利亚诺格洛(Steve Lianoglou),彼得·哈弗蒂(Peter Haverty)

维护者:Russell Bainer

引用(从r内,输入引用(“ gcrisprtools”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ gcrisprtools”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ gcrisprtools”)

html R脚本 example_workflow_gcrisprtools
html R脚本 gcrisprtools_vignette
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(4。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.6)
进口 生物酶,,,,林玛,,,,Robustrankaggreg,,,,GGPLOT2,,,,panther.db,,,,rmarkDown,grdevices,图形,统计,utils,并行,总结性特征
链接
建议 EDGER,,,,尼特, 网格,AnnotationDbi,,,,org.mm.eg.db,,,,org.hs.eg.db,,,,运行,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gcrisprtools_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 gcrisprtools_1.18.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) gcrisprtools_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gcrisprtools
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/gcrisprtools
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/gcrisprtools/
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