Genefilter.

DOI：10.18129 / b9.bioc.genefilter

Genefilter：从高通量实验过滤基因的方法

Biocometiond版本：释放（3.12）

过滤基因的一些基本功能。

作者：R. Gentleman，V. Carey，W. Huber，F. Hahne

维护者：Bioconductor Package维护者

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！qualocamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“genefilter”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“Genefilter”）

PDF.	r script.	额外的图表：独立过滤增加了检测差异表达基因的功率，Bourgon等人，PNA（2010）
PDF.	r script.	独立筛选的诊断
PDF.	r script.	如何查找其表达概况与指定基因类似的基因
PDF.	r script.	使用GeneFilter函数从微阵列数据集中过滤基因
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.72.0
在生物导体中以来	BIOC 1.6（R-2.1）或更早版本（> 15.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠
进口	生物根系（> = 0.31.2），annotationdbi.那注释那BioBase.，图形，方法，统计数据，生存
链接到
建议	班级那hgu95av2.db.那TKWidgets.那全部那鹏那DESEQ.那帕西拉那rcolorbrewer.那生物焦那kn
系统要求
加强
URL.
取决于我	cellhts2.那cntools.那flowsorted.blood.epic.那Genemeta.那hiiragi2013那牧师那rnaseqgene.那simpleaff.那SISPA.那SVA.
进口我	A4Base.那affyqcreport.那阿尔卑斯山那annmap.那ArrayqualityMetrics.那类别那CBAF.那countsimqc.那Covrna那DESEQ.那deseq2.那Dexseq.那艾莎那enmix.那exoMepeak2.那GGBase.那GISPA.那GSRI.那ihwpaper.那JunctionSeq.那METASEQR2.那甲烷分析那Methylcc.那弥撒那Minfi.那ml interfaces.那沼泽那nbamseq.那pcaexplorer.那佩奇那现象那Pwrewas.那林诺那rnainteractmapk.那simpleaff.那spatialheatmap.那t那XDE.那Zinbwave.
建议我	yeasyExpress那注释那ArrayTools.那Bioccasestudies.那二乙衫那Bloodcancermultiomics2017那CompoundationCompare.那classifyr.那Clusterstab.那Codelink.那可乐那Compcoder.那CutatedBladderData.那CutatedCrcdata.那Cutatedovarardata.那delayedarray那enroichedheatmap.那factdesign.那FFPE.那ffpeexampledata.那Gagetata.那genogam.那基因组夫妇那古司裤那GSAR.那GSEALM那GSVA.那Logicfs.那lumi.那MAQCSUBSET.那mmuphin.那NPGSEA.那oligo.那文学那PVAC.那QPGraph..那林葛普查组织那RheumaticConditionWollbold.那rtracklayer.那siggenes.那single.mtec.transcriptomes.那SSPA.那tcgabiolinks.那顶点
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	Genefilter_1.72.0.tar.gz.
Windows二进制文件	Genefilter_1.72.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	Genefilter_1.72.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/genefilter
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/ genefilter
包短网址	https://biocumon.org/packages/genefilter/
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