genefu

DOI:10.18129 / B9.bioc.genefu

乳腺癌中基于基因表达特征的计算

Bioconductor版本:发布(3.15)

该软件包包含实现基因表达分析通常需要的各种任务的功能，特别是在乳腺癌研究中:不同微阵列平台之间的基因定位，分子亚型的鉴定，已发表基因签名的实现，基因选择和生存分析。

作者:Deena M.A. Gendoo [aut]， Natchar Ratanasirigulchai [aut]， Markus S. Schroeder [aut]， Laia Pare [aut]， Joel S Parker [aut]， Aleix Prat [aut]， Nikta Feizi [ctb]， Christopher Eeles [ctb]， Benjamin Haibe-Kains [aut, ctb]

维护者:Benjamin Haibe-Kains < Benjamin .haibe。凯恩在多伦多

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("genefu")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“genefu”)

超文本标记语言	R脚本	genefu:用于乳腺癌基因表达分析的软件包
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文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	2.28.0
在Bioconductor中	BioC 2.8 (R-2.13)(11岁)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.1)，survcomp，biomaRt，iC10，目标
进口	北极监测和评估方案，嫁祸于，mclust，limma，图形，统计，utils
链接
建议	GeneMeta，breastCancerVDX，breastCancerMAINZ，breastCancerTRANSBIG，breastCancerUPP，breastCancerUNT，breastCancerNKI，rmeta，Biobase，xtable，knitr，脱字符号，生存，BiocStyle，魔法，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.pmgenomics.ca/bhklab/software/genefu
这取决于我
进口我	consensusOV，PDATK
建议我	breastCancerMAINZ，breastCancerNKI，breastCancerTRANSBIG，breastCancerUNT，breastCancerUPP，breastCancerVDX，GSgalgoR
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	genefu_2.28.0.tar.gz
Windows二进制	genefu_2.28.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	genefu_2.28.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genefu
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/genefu
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/genefu/
软件包下载报告	下载数据