基因组知识

doi：10.18129/b9.bioc.genomicinstability

SCRNA-SEQ的基因组不稳定性估计

生物导体版本：版本（3.15）

该软件包包含从SCRNA-SEQ数据运行基因组不稳定性分析（GIA）的功能。GIA估计了编码基因的基因表达与基因组位置之间的关联。它使用该区域算法来量化基因表达曲线上连续基因集（位点）的富集，并估计每个分析的细胞的基因组不稳定性评分（GIS）。

作者：Mariano Alvarez [AUT，CRE]，Pasquale Laise [AUT]，Darwinhealth [CPH]

维护者：Mariano Alvarez

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ GenomicInstability”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“基因组知识”）

PDF	R脚本	使用基因组知识
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.2.0
在生物导体中	Bioc 3.14（R-4.1）（1年）
执照	文件执照
要看	r（> = 4.1.0），检查员
进口	混音工具，，，，总结性特征
链接
建议	Singlecellexperiment，，，，实验室，，，，Proc
系统要求
增强
URL	https://github.com/darwinhealth/genomicinstability
BugReports	https://github.com/darwinhealth/genomicinstability
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	genomicinstability_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	genomicinstability_1.2.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Genomicinstability_1.2.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomicinstability
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/genomicinstability
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/genomicinstability/
软件包下载报告	下载统计