genotypeeval

DOI:10.18129 / B9.bioc.genotypeeval

gVCF或VCF文件的QA/QC

生物导体版本:发布(3.12)

采用gVCF或VCF并报告评估呼叫质量的指标。

作者:Jennifer Tom

维护者:詹妮弗·汤姆<汤姆。珍妮花:gene.com >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install(“基因类型eval”)

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“genotypeeval”)

超文本标记语言		genotypeeval_vignette.html
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (R-3.2)(5.5年)
许可证	文件许可证
取决于	R (> = 3.4.0),VariantAnnotation
进口	ggplot2,rtracklayer,BiocGenerics,GenomicRanges,GenomeInfoDb,IRanges、方法、BiocParallel、图形、统计数据
链接
建议	rmarkdown,testthat,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	genotypeeval_1.22.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	genotypeeval_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genotypeeval
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ genotypeeval
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/genotypeeval/
包下载报告	下载数据