gespeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.gespeR

Gene-Specific表型估计量

Bioconductor版本:发行版(3.15)

从脱靶混杂RNAi筛选中估计基因特异性表型。每个siRNA的表型是基于靶向基因和非靶向基因建模的，使用正则化线性回归模型。

作者:费边Schmich

维护者:Fabian Schmich < Fabian。在bsse.ethz.ch schmich >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("gespeR")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“gespeR”)

PDF	R脚本	一个R包，用于反卷积脱靶混杂RNAi屏幕
PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (R-3.2)(7年)
许可证	GPL-3
取决于	方法、图形ggplot2， r (>= 2.10)
进口	矩阵，glmnet，cellHTS2，Biobase，biomaRt，doParallel平行,foreach，reshape2，dplyr
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cbg.ethz.ch/software/gespeR
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	gespeR_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	gespeR_1.28.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	gespeR_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gespeR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gespeR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/gespeR/
包下载报告	下载数据