ggcyto

DOI:10.18129 / B9.bioc.ggcyto

用ggplot可视化细胞术数据

Bioconductor版本:发行版(3.15)

通过对flowSet、ncdfFlowSet和GatingSet类实现专用的强化方法，可以使用ggplot直接绘制原始流式细胞术数据和门控流式细胞术数据。Ggcyto包装器和一些定制层还可以方便地向图中添加门和人口统计信息。

作者:Mike Jiang

维护者:Mike Jiang < Mike at ozette.com>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ggcyto")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“ggcyto”)

超文本标记语言	R脚本	ggcyto的特性总结
超文本标记语言	R脚本	快速绘制细胞术数据图
超文本标记语言	R脚本	使用ggcyto可视化流集
超文本标记语言	R脚本	用ggcyto可视化GatingSet
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细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.24.1
在Bioconductor公司	BioC 3.3 (R-3.3)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,ggplot2(> = 3.3.0),flowCore(> = 1.41.5),ncdfFlow(> = 2.17.1),flowWorkspace(> = 3.33.1)
进口	plyr，尺度，hexbin，data.table，RColorBrewer，gridExtra，rlang
链接
建议	testthat，flowWorkspaceData，knitr，rmarkdown，flowStats，openCyto，flowViz，ggridges，vdiffr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RGLab/ggcyto/issues
全靠我
进口我	CytoML
建议我	催化剂，flowCore，flowStats，flowTime，flowWorkspace，openCyto
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ggcyto_1.24.1.tar.gz
Windows二进制	ggcyto_1.24.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ggcyto_1.24.1.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggcyto
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ggcyto
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ggcyto/
软件包下载报告	下载数据
bioc3.15的旧源包	源存档