glmGamPoi

DOI:10.18129 / B9.bioc.glmGamPoi

拟合Gamma-Poisson广义线性模型

生物导体版本:发布(3.12)

对过分散计数数据拟合线性模型。该软件包可以估计矩阵输入的过度分散和拟合重复模型。它被设计用来处理大的输入数据集，因为它们通常发生在单细胞rna测序实验中。

作者:Constantin Ahlmann-Eltze， Michael Love [ctb]

维护者:Constantin Ahlmann-Eltze

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("glmGamPoi")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“glmGamPoi”)

超文本标记语言	R脚本	glmGamPoi快速入门
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	Rcpp，DelayedMatrixStats，matrixStats，DelayedArray，HDF5Array，SummarizedExperiment，方法，统计，效用，样条
链接	Rcpp，RcppArmadillo，beachmat
建议	testthat(> =魅惑,动物园，DESeq2，刨边机，limma，beachmat，质量，statmod，ggplot2，板凳上，BiocParallel，knitr，rmarkdown，BiocStyle，TENxPBMCData，食物
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/const-ae/glmGamPoi
BugReports	https://github.com/const-ae/glmGamPoi/issues
取决于我
进口我
建议我	DESeq2
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	glmGamPoi_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	glmGamPoi_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	glmGamPoi_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/glmGamPoi
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ glmGamPoi
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/glmGamPoi/
包下载报告	下载数据