GPART.

DOI：10.18129 / b9.bioc.gpart.

通过识别单倍型块来分配致密测序数据的人类基因组分配

Bioconductor版本：释放（3.13）

我们提供了一种新的SNP序列分区方法，其基于LD块结构的不仅基于LD块结构来分区整个SNP序列，而且是基因位置信息。GPART的LD块结构使用大型LD算法进行，并在Kim等人报告的先前版本中进行了额外的改进。（2017）。我们还添加了一个可视化工具，以显示LD Heatmap，其中包含LD块边界和包装中的基因位置。

作者：Sun Ah Kim [Aut，Cre，Cph]，Yun Joo Yoo [Aut，CPH]

维护者：Sun Ah Kim

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percenameSpace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“gpart”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.10.0
在生物导体中以来	BIOC 3.8（R-3.5）（2.5岁）
执照	mit +文件执照
依靠	R（> = 3.5.0），网格，homo.sapiens.那txdb.hsapiens.ucsc.hg38.knowngene.
进口	iGraph.那生物雕那rcpp.那data.table.那Organismdbi.那annotationdbi.，grdevices，stats，utils，Genomicranges.那绞喉
链接到	rcpp.
建议	kn那RAMAMAMDOW.那生物焦那testthat.
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	gpart_1.10.0.tar.gz.
Windows二进制文件	gpart_1.10.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	gpart_1.10.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/gpart.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ gpart
包短网址	https://biocumon.org/packages/gpart/
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