Gscreend

doi:10.18129/b9.bioc.gscreend

合并遗传筛选的分析

生物导体版本:版本(3.15)

用于分析合并遗传筛查的包装(例如CRISPR-KO)。此类筛选的分析基于细胞增殖阶段之前和之后的GRNA丰度的比较。Gscreend包装将GRNA计数作为输入,并允许检测其敲除的基因减少或增加细胞增殖。

作者:Katharina Imkeller [CRE,AUT],Wolfgang Huber [AUT]

维护者:dkfz.de>的katharina imkeller

引用(从r内,输入引用(“ Gscreend”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Gscreend”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Gscreend”)

html R脚本 example_simulated
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.6)
进口 总结性特征,,,,nloptr,,,,fgarch, 方法,生物比较,图形
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/imkeller/gscreend
BugReports https://github.com/imkeller/gscreend/issues
取决于我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gscreend_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 gscreend_1.10.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) gscreend_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gscreend
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/gscreend
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/gscreend/
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