GSEAN

doi:10.18129/b9.bioc.gsean

基因集富集分析与网络

生物导体版本:版本(3.15)

活生物体中的生物分子很少单独起作用。他们通常以合作的方式相互互动。生物过程太复杂了,无法理解而不考虑这种相互作用。因此,基于网络的程序可以看作是研究复杂过程的强大方法。但是,设计了许多用于分析单个基因的方法。据说,基于基因共表达等生物网络的技术比仅使用基因列表的技术更精确地表示信息。该软件包的目的是整合基因表达和生物网络。由基因表达数据构建的生物网络,并用于基因集富集分析。

作者:Dongmin Jung

维护者:dongmin jung

引用(从r内,输入引用(“ Gsean”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ GSEAN”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Gsean”)

html R脚本 GSEAN
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细节

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版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(4年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.5),fgsea,,,,ppinfer
进口
链接
建议 总结性特征,,,,尼特,,,,情节,等级,WGCNA,,,,rmarkDown
系统要求
增强
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取决于我
进口我
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链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gsean_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 gsean_1.16.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) gsean_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gsean
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/gsean
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/gsean/
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