Bioconductor版本:发行版(3.15)
这个包为用户提供查询单细胞实验数据的Human Cell Atlas数据存储库的能力。' projects() '、' files() '、' samples() '和' bundles() '函数检索这些索引的摘要信息;对应的' *_details() '可用于每个索引的单个条目。基于文件的资源可以使用' files_download() '来下载。该包的高级用法允许用户在大型结果集中进行分页,并灵活地查询表示查询响应的“列表中的列表”结构。
作者:玛雅·麦克丹尼尔[aut],马丁·摩根[aut, cre]
维护者:马丁·摩根<马丁。摩根:roswellpark.org>
引用(从R中,输入引用(hca)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("hca")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes (hca)
超文本标记语言 | R脚本 | 获取人类细胞图谱数据 |
超文本标记语言 | R脚本 | 使用人类细胞图谱清单工作 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.13 (R-4.1)(1年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | R (>= 4.1) |
进口 | httr,jsonlite,dplyr,宠物猫,tidyr,readr,BiocFileCache工具,效用,消化 |
链接 | |
建议 | futile.logger,LoomExperiment,SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,S4Vectors、方法、testthat(> = 3.0.0),knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | hca_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | hca_1.4.0.zip(64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | hca_1.4.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hca |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/hca |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/hca/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
bioc3.15的旧源包 | 源存档 |
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Bioconductor
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