Hiannotator.

DOI：10.18129 / b9.bioc.hiannotator.

用于注释格晶体对象的功能

Bioconductor版本：释放（3.13）

Hianotator包含一组函数，允许用户使用自定义注释集注释一个granges对象。The basic philosophy of this package is to take two GRanges objects (query & subject) with common set of seqnames (i.e. chromosomes) and return associated annotation per seqnames and rows from the query matching seqnames and rows from the subject (i.e. genes or cpg islands). The package comes with three types of annotation functions which calculates if a position from query is: within a feature, near a feature, or count features in defined window sizes. Moreover, each function is equipped with parallel backend to utilize the foreach package. In addition, the package is equipped with wrapper functions, which finds appropriate columns needed to make a GRanges object from a common data frame.

作者：nirav v malani

维护者：Nirav V Malani

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“hiannotator”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“Hiannotator”）

HTML.	r script.	使用Hianotator.
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.26.0
在生物导体中以来	BIOC 3.0（R-3.1）（6.5岁）
执照	GPL（> = 2）
依靠	Genomicranges.，r（> = 2.10）
进口	Foreach.那迭代器那rtracklayer.那dplyr.那bsgenome.那ggplot2.那秤， 方法
链接到
建议	kn那多达齐全那testthat.那生物根系
系统要求
加强
URL.
取决于我	HireadsProcessor.
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	hiannotator_1.26.0.tar.gz.
Windows二进制文件	hianotator_1.26.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	hianotator_1.26.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/hiannotator.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/ hiannotator
包短网址	https://biocumon.org/packages/hiannotator/
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