Bioconductor版本:Release (3.16)
使用所有snp的联合模型测试单个snp,以及GWA研究中的任意大组snp。该方法控制了FWER,并提供了一个自动的、数据驱动的SNP簇细化到更小的组或单个标记。
作者:Laura Buzdugan
维护者:Laura Buzdugan < Buzdugan at stat.math.ethz.ch>
引用(来自R,输入引用(“hierGWAS”)
):
要安装这个包,启动R(版本"4.2")并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") biomanager::install("hierGWAS")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放。
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“hierGWAS”)
R脚本 | R-Package hierGWAS用户手册 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.28.0 |
在Bioconductor中 | BioC 3.2 (R-3.2)(7.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.2.0) |
进口 | fastcluster,glmnet,fmsb |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,RUnit,质量 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | hierGWAS_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | hierGWAS_1.28.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | hierGWAS_1.28.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | hierGWAS_1.28.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/hierGWAS |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/hierGWAS |
Bioc软件包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/hierGWAS/ |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/hierGWAS/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor
支持»
请阅读发布指南。将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: