Hipathia

doi：10.18129/b9.bioc.hipathia

Hipathia：高通量途径分析

生物导体版本：版本（3.13）

Hipathia是一种从转录组数据中计算信号转导通路的信号转导方法的方法。该方法基于一种迭代算法，该算法能够考虑每个基因的表达水平以及信号到达该基因的强度来计算通过网络节点的信号强度。它还提供了一种新方法来进行功能分析，从而可以计算到到达每个途径的功能的信号到达的信号。

作者：Marta R. Hidalgo [AUT，CRE]，JoséCarbonell-Caballero [CTB]，Francisco Salavert [CTB]，Alicia Amadoz [CTB]，ÇankutCubuk[CTB]，Joaquin Dopazo [CTB] [CTB]

维护者：Marta R. Hidalgo

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ hipathia”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Hipathia”）

PDF	R脚本	Hipathia包
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	2.8.0
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（3年）
执照	GPL-2
要看	r（> = 3.6），Igraph（> = 1.0.1），AnnotationHub（> = 2.6.5），多亚sayExexperiment（> = 1.4.9），总结性特征（> = 1.8.1）
进口	硬币，统计林玛，grdevices，utils，图形，预处理，，，，服务，，，，延迟，，，，矩阵， 方法，S4VECTORS
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	hipathia_2.8.0.tar.gz
Windows二进制	hipathia_2.8.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	hipathia_2.8.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hipathia
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/hipathia
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/hipathia/
软件包下载报告	下载统计